Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn17Q8BXA6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Cldn17Q8BXA6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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