Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sall4Q8BX22 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms