Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ctdsp2Q8BX07 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ctdsp2Q8BX07 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ctdsp2Q8BX07 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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