Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pggt1bQ8BUY9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pggt1bQ8BUY9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pggt1bQ8BUY9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pggt1bQ8BUY9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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