Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efemp1Q8BPB5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms