Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf18Q8BM39 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Prpf18Q8BM39 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prpf18Q8BM39 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Prpf18Q8BM39 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Prpf18Q8BM39 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf18Q8BM39 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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