Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zcchc4Q8BKW4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc4Q8BKW4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms