Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gpc2Q8BKV1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms