Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gabra5Q8BHJ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra5Q8BHJ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms