Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q8BGN9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Q8BGN9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms