Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Htatsf1Q8BGC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms