Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ChfrQ810L3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ChfrQ810L3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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