Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dsg1bQ7TSF1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms