Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dsg1cQ7TSF0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms