Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ckap2lQ7TS74 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ckap2lQ7TS74 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms