Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clec4b1Q7TS58 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clec4b1Q7TS58 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms