Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nphp3Q7TNH6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nphp3Q7TNH6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms