Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sbno2Q7TNB8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbno2Q7TNB8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms