Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HhipQ7TN16 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HhipQ7TN16 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms