Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Uhrf2Q7TMI3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Uhrf2Q7TMI3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Uhrf2Q7TMI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Uhrf2Q7TMI3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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