Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
STRCQ7RTU9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STRCQ7RTU9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms