Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScocQ78YZ6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ScocQ78YZ6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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