Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY3

Rps27l, 40S ribosomal protein S27-like, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27lQ6ZWY3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps27lQ6ZWY3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rps27lQ6ZWY3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms