Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smpd4Q6ZPR5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smpd4Q6ZPR5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms