Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp8b3Q6UQ17 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms