Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc82Q6PG04 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc82Q6PG04 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms