Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Taf1cQ6PDZ2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms