Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp49Q6P9L4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp49Q6P9L4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms