Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ParpbpQ6IRT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms