Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt72Q6IME9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms