Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt39Q6IFX4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt39Q6IFX4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms