Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Arhgap20Q6IFT4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms