Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atg9bQ6EBV9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms