Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cntn4Q69Z26 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms