Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sbno1Q689Z5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sbno1Q689Z5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms