Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q66JV7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q66JV7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q66JV7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q66JV7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q66JV7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q66JV7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms