Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc8eQ66JT1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms