Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ctnna3Q65CL1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnna3Q65CL1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms