Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a3Q64518 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a3Q64518 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp2a3Q64518 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp2a3Q64518 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms