Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Top2bQ64511 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Top2bQ64511 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms