Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc18Q640L5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc18Q640L5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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