Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Polr2kQ63871 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Polr2kQ63871 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms