Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Vat1Q62465 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vat1Q62465 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms