Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20865Q62460 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20865Q62460 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms