Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sp4Q62445 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sp4Q62445 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms