Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim28Q62318 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim28Q62318 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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