Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Sprr1bQ62267 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Sprr1bQ62267 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms