Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SnrpaQ62189 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SnrpaQ62189 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms