Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ttf1Q62187 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ttf1Q62187 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Ttf1Q62187 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ttf1Q62187 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttf1Q62187 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ttf1Q62187 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms