Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd55Q61475 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd55Q61475 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd55Q61475 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd55Q61475 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cd55Q61475 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms